مرکز پژوهشی نفت دانشگاه خوارزمی به عنوان مرکز مدیریت و راهبری پژوهش های علمی، بنیادی و کاربردی با رویکرد توسعه فناوری در صنایع بالادستی نفت و گاز در سال 1395 در دانشگاه خوارزمی تاسیس گردید. نیروی انسانی این پژوهشکده از اعضای هیات علمی تمام وقت دانشکده های مختلف دانشگاه خوارزمی و اساتید همکار دانشگاه دارای سوابق اجرای پروژه های بالادستی نفت و گاز می باشد. این پژوهشکده در حال حاضر در پروژه های صنعتی و پژوهشی حوزه صنایع بالادستی مهندسی نفت و گاز فعالیت دارد.